柯文哲近日在廣播節目《POP撞新聞》中提及萊豬議題，強調自己始終主張「源頭管理、明白標示」，也說明「未來日本核食進口也會用同樣標準」，否則台北市府有機會另設置「福島核食專區」，並不諱言此事帶有外交壓力，若不開放，將有可能得罪日本，影響外交。
柯文哲透露曾和岸信夫聊到核食議題，對方語帶不悅，表示蔡英文曾當面允諾，卻遲遲未做出行動，並說明蔡英文在第一任期期間就答應。但柯文哲表示雖然他自己無法提出證據確認此事，但日方確實說有。
隨後府方回應，蔡總統於公開場合或非公開會面的態度皆一致，沒有所謂的「私下承諾」，「至於柯市長轉述他與日本議員談話的內容，我們無從得知，也不予置評。」總統府發言人張惇涵表示，在蔡總統第一任期時，確實有就日本食品進口議題的相關討論，當時行政部門也有就相關專業進行發表，並非如柯市長所言「沒有作為」，之後因國民黨發動公投的結果，政府部門必須尊重公投結果來依法行政。他也強調，目前政府部門並未討論日本食品進口議題。
另許多民眾關心農委會推出台灣豬標章，但商家該如何使用？民眾如何辨識？開放半個月仍許多模糊空間，引發民進黨立委高嘉瑜近日炮轟農委會，把標章管理責任推給商家，顯然是一大缺失，並氣憤表示台灣豬標章應貼在農委會主委陳吉仲頭上。
但萊豬尚未叩關，立院就已滿城風雨，蘇揆近日宴請民進黨多位立委談到萊豬時，黨團總召柯建銘轉述蘇揆說法，表示美國萊豬還未進口，「水龍頭都關了，國民黨還在拿抹布擦地。」祕書長李孟諺則就台灣豬標章狀況向各立委表示，農委會核發的標章是種榮譽象徵，店家產品，除腸衣外，其他台灣豬肉製品只要申請就有清楚標章，會有立體印刷、防偽，以保障國人健康無虞。
